Один из довольно молодых футбольных клубов РПЛ. Основан путём объединения любительских команд «Новатор» и «Родина» из локального первенства. Дебютировал в РПЛ в 2007 году.
Главный тренер "Оренбурга" Владимир Слишкович прокомментировал победу своей команды над подмосковными "Химками" в матче Кубка России сезона-2024/25 (2:0).