Один из довольно молодых футбольных клубов РПЛ. Основан путём объединения любительских команд «Новатор» и «Родина» из локального первенства. Дебютировал в РПЛ в 2007 году.
Подмосковные "Химки" включили в заявку на сезон РПЛ 18-летнего Григория Лоськова, сына бывшего капитана "железнодорожников" и футболиста сборной России Дмитрия Лоськова.