Один из довольно молодых футбольных клубов РПЛ. Основан путём объединения любительских команд «Новатор» и «Родина» из локального первенства. Дебютировал в РПЛ в 2007 году.
Министр спорта Московской области Роман Терюшков выразил мнение о коллективном письме футболистов "Химок" на имя губернатора в защиту экс-главного тренера команды Сергея Юрана.