Один из довольно молодых футбольных клубов РПЛ. Основан путём объединения любительских команд «Новатор» и «Родина» из локального первенства. Дебютировал в РПЛ в 2007 году.
Экс-главный тренер "Томи" и сборной Камеруна Валерий Непомнящий ответил на вопрос об ожиданиях от московского "Спартака" в выездном матче 2 тура РПЛ с подмосковными "Химками".