Один из довольно молодых футбольных клубов РПЛ. Основан путём объединения любительских команд «Новатор» и «Родина» из локального первенства. Дебютировал в РПЛ в 2007 году.
Глава РПЛ Александр Алаев прокомментировал ситуацию с возможным запретом на участие в матче 5-го тура "Химки" - "Зенит" полузащитника Зелимхана Бакаева.
Генеральный директор "Химок" Николай Оленев объяснил комментарий главного тренера красно-черных Франко Артиги о том, что Зелихман Бакаев не может играть с "Зенитом".